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Seaphages宿主細菌簡介
發布時間： 2022-09-16 點擊次數： 661次北京華新康信現貨 大力回饋新老客戶，現貨打折出售，現有品牌和種類，新老客戶可以自由選購：
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北京華新康信也有Seaphages實驗試劑銷售，下面給大家講講Seaphages服務以及實驗樣本；
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Seaphages
宿主細菌
擁有800 多個已測序的分枝桿菌噬菌體，我們熱衷于擴大我們的網絡，將在放線菌門內其他宿主上分離的噬菌體包括在內。這包括噬菌體，如節桿菌屬、戈登氏菌屬和紅球菌屬。
作為實現這一激動人心目標的手段，SEA-PHAGES 團隊將分3 個階段對新的放線菌宿主進行試驗，每個階段都將告知下一個最終目標，即建立*佳實踐以協助整個 SEA 的噬菌體工作。
SEA-PHAGES 教師可以自愿參與這項工作的任何或所有步驟。各階段描述如下。
單擊此處查看當前處于 SEA-PHAGES 管道中的主機。
第一階段：識別
識別階段是將主機添加到我們的集合的第一步。此階段的目標是確定宿主是否普遍適合課堂噬菌體環境。這一階段可能由匹茲堡大學的 Hatfull 實驗室、HHMI SEA-phages 小組或 SEA-PHAGES 計劃內的任何機構進行。
您可以通過選擇要處理的放線菌宿主并確定以下內容來參與此階段：
生長參數（培養基、溫度、孵育時間、菌落形態）
使用富集發現噬菌體的頻率
請注意，處于鑒定階段的宿主可能只是經過初步測試（即菌落和草坪可以在固體培養基上生長）。因此，這一階段的測試可能適合獨立實驗室項目。如果您有興趣選擇除試點之外的放線菌宿主，我們建議您使用符合以下標準的宿主。
是一種 BSL1 放線菌
具有與課堂時間表兼容的生長條件
像草坪一樣容易生長
可以分發給或可供 SEA-PHAGES 社區使用
第 2 階段：試點
當宿主已經充分表征并確定了獲得斑塊的基本指南時，它們可能會進入試驗階段。此階段的目標是在許多不同的實施環境中測試主機，并收集有關在 SEA-PHAGES 教室中使用主機的大量數據。這一階段通常由 SEA-PHAGES 領導層協調，并涉及在同一學年在同一主機上工作的多個機構。
如果您選擇參與試點階段，您將測試以下參數：
噬菌體感染（富集、斑塊形成/形態、緩沖液、滴度、儲存）
分子生物學（DNA 提取、限制性分析、測序、電子顯微鏡）
第 3 階段：驗證
經過驗證的主機現已準備好在 SEA-PHAGES 教室中廣泛使用。基于試驗數據的標準化協議可用于補充資源指南，協議發布在 PhagesDB 上。
主機選擇指南
新的 SEA-PHAGES 學院
我們強烈鼓勵所有新加入 SEA-PHAGES 計劃的教職員工在采用新宿主之前使用 SEA 團隊為您選擇的細菌宿主成功實施一年的課程。成功的一年將需要通過向 GenBank 提交至少一個帶注釋的基因組來分離噬菌體。
目前的 SEA-PHAGES 教師
歡迎以前實施過 SEA-PHAGES 計劃的教職員工參與開發新宿主的所有階段。如果您決定測試新主機，請通過 info@seaphages.org 向 SEA-PHAGES 團隊發送電子郵件，并附上您選擇的主機和您打算如何實施試點的簡要說明（例如在實驗室中或在教室）。
與新主機合作
當您開始使用新宿主時，我們建議您按照資源指南或 PhagesDB 提供的協議中描述的恥垢分枝桿菌mc 2 155 的說明進行操作，但有以下關鍵例外。
首先在 30°C 的 PYCa 培養基中培養新的放線菌。準備 PYCa 媒體的協議可以在 PhagesDB 中找到。一旦您熟練使用新宿主，您就可以測試替代生長培養基和溫度。
可以在 PhagesDB 上找到使用新主機的其他注意事項。
我們要求在新主機上工作的教職員工保持嚴謹的筆記，以便我們能夠快速有效地建立*佳實踐。與新主機合作的數據將使用 SEA-PHAGES 團隊發送的在線數據收集表收集。您可以在此處查看數據收集表，以熟悉將被請求的信息類型。
SEA-PHAGES 宿主細菌的當前管道
恥垢分枝桿菌 mc²155
已驗證| 空中交通管制委員會： 700084
協議
噬菌體：發現 11861 個| 2109 已測序
球形節桿菌 B-2979
已驗證
噬菌體：發現 561個| 144 測序
節桿菌屬 空中交通管制委員會 21022
已驗證| 空中交通管制委員會： 21022
噬菌體：發現 707個| 226 測序
灰色鏈霉菌 ATCC 10137
已驗證| 空中交通管制委員會： 10137
噬菌體：發現 444個| 109 測序
Gordonia rubripertincta NRRL B-16540
已驗證
噬菌體：發現 254 個| 85個測序
Gordonia terrae 3612
已驗證| 空中交通管制委員會： 25594
噬菌體：1917 年發現| 464 已排序
小葉微桿菌 NRRL B-24224
已驗證
噬菌體：發現 3191個| 437 已排序
紅球菌 RIA 643
試點| 空中交通管制委員會： 15903
最初在 ATCC 上列為紅球菌。
噬菌體：發現 95 個| 41個測序
鏈霉菌 xanthochromogenes NRRL B-5410
試點
噬菌體：發現 45 個| 19 測序
短桿菌 NRRL B-14687
試點
噬菌體：發現 3 個| 1 個已排序
綠色發色鏈霉菌 DSM40736
鑒別
噬菌體：發現 27個| 18個測序
葡萄球菌NCIB 9291
識別| 空中交通管制委員會： 10234
噬菌體：發現 13 個| 8 測序
副氧化微桿菌 NWU1
鑒別
被內布拉斯加衛斯理大學隔離
噬菌體：發現 212 個| 29 測序
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其他的這些是菌株
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